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从这一部开始，所谓的真实世界场景从狭窄的巴比伦王尼布甲撒二世号，扩展到了广阔的锡岸城；墨菲斯从一个强悍霸气的船长，变成了锡岸城非顶层的一员，正在以热血方式争取自己的政治地位；尼欧和“the-one”的说法，在锡岸城里只是备受怀疑的传说……
但是，这个所谓的真实世界本身的真实性也展现出了可疑之处，墨菲斯一直坚信的命运的残酷真相也逐渐暴露：锡岸城只不过是更深一层的at日x，尼欧的超能力并不是什么神迹，而是重新洗牌的征兆。
同时，命运的转机也到来了。
人类的叛逆精神传染了史密斯特工，使得at日x失控，而各种程序（如预言师）也在进化，甚至出现情感（如贝鲁尼）。而且，贝鲁尼的台词暗示，尼欧将来会脱离人类属性，成为一个新的强大程序。
到了这第二部《重装上阵》的最后，幕后的建筑师站了出来，说这一次人类系统的崩溃和重装过程会有所不同，请尼欧选择，对他自己来说之前多次的救世主reloading方法已经厌烦了……
在爱情和锡岸城之间，他选择去拯救爱情，为第三部留下悬念。
似乎这个版本的“黑客帝国”，在陈天都的打造之下，zion愈发的让人难以分辨真假。或者说，是更加侧重渲染它的虚幻性。才能超出原作的打造出一个摸凌两可的开放性结局。
“action！”
随着陈天都的一声令下。摄影机开始了运作。而镜头中的几位演员也随即进入角色，进入到《黑客帝国》世界。
周运发饰演的钥匙匠嘴里嚼着巧克力，一边用玩世不恭的神色说着台词，“那是一栋大楼…超出你的想象…世界的核心。”
连用了三个断句，一句更比一句突显内容，而且语调各有不同。让镜头后面的陈天都看的暗自点头，发哥的演技依然是神乎其技。
“在核心出有一层楼，搭电梯上不去。走楼梯也去不了。那层楼到处都是后门，这些门能连通很多地方，隐秘的地方。只有一道门才是你们需要的……”说到这里他顿了顿，巧克力也不嚼了，“通往万物之源……必须在既定时间内切断电源……只有救世主能够打开那道门，也只有在这段时间内能够办到。”
“你怎么知道这么多？”
周运发露出标志性的“赌神”一笑，扭头看向她，“因为我非知道不可，这就是我存在的目的，也是我存在的意义。也是大家存在的原因。只要一个环节出错，所有人……”他忽然一笑。做出一个手指握拳虚张的手势，“gae-over，砰！”
“cut，过了。”
陈天都喊道：“很精彩。”
周运发站起来，笑了笑。陈天都也笑了笑，一切尽在不言中。继而转头向凯特喊道：“凯特，下一场准备好了吗？”
“你该问道具准备好了没有。”凯特已经骑上了摩托车，身上绑着威亚钢索。
一头短发随风飘扬，与原作中打了厚厚一层发蜡完全不同，更加增添青春气息。女神就是女神，凯特似乎天生就适应潇洒的动作戏。尤其是这副黑色皮衣加一辆劲爆摩托的造型，看的周围男士都移不开眼。
陈天都走过去，关心问道：“你确定不需要替身吗？这个镜头并不好把握。”
“我没问题，可以的。”凯特吐了口气，启动了摩托点火。陈天都不再说什么，退出场地来。孔乙己举着摄影机走进来，喊道：“等等，我先拍个花絮，对着镜头打个招呼凯特。”
凯特闻言朝他的镜头里招了招手，笑道：“大家好，我现在要拍一场非常酷的戏，至于是什么，呵呵，就不告诉你们了。”然后调皮的去伸手捂镜头。